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真核mRNA測序5-6G
服務介紹:
轉錄組測序(mRNA-seq):基于Illumina測序平臺,對某一物種或特定細胞在某一功能狀態下產生的mRNA進行高通量測序,既可以提供定量分析,檢測基因表達水平差異,又可以提供結構分析,發現稀有轉錄本,并且對差異表達基因進行功能注釋。
名稱 | 規格 |
真核mRNA測序5-6G | /個樣 |
真核mRNA測序10-12G | /個樣 |
實驗流程:
樣本處理-TotalRNA抽提與質檢-文庫構建-PE150測序-數據分析;
送樣運輸要求:
1)樣品類型:細胞、動物新鮮組織、植物組織、全血、血清、血漿、石蠟切片、或RNA樣品。
2)樣品的量:新鮮動物組織 ≥100mg(含肌纖維或脂肪等組織的樣品 RNA 含量較低,送樣量需增加)。新鮮培養細胞 ≥5×106 個(請清洗后離心得細胞沉淀,用 TRIzol 充分裂解并干冰運輸)。新鮮全血 ≥1mL(新鮮血液樣本,不可使用凍存血。建議向新鮮血液中加入 3 倍體積的 TRIzol LS 裂解液,干冰運輸)。血清,血漿(一般是用至少2ml的全血分離出來的量)。PBMC>1*107(加Trzol混勻,避免反復凍融)。植物組織 ≥1g(含多糖多酚等的復雜植物組織,請盡可能多的送樣)。石蠟切片5-10 張/卷(未經 HE 染色的切片;厚度≥5µm;組織區域面積≥10mm×10mm;有核細胞比例>80%;腫瘤細胞比例>20%。建議使用 1 年內的 FFPE 樣本)。
3)樣品質量:RNA無明顯降解,提取的總RNA OD260/280值在1.8~2.2之間,濃度 ≥ 500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 7。
4)樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)可用TRIZOL或RNA保護劑處理或液氮凍存后,-80℃保存。RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80℃保存。樣品保存期間避免反復凍融。
5)樣品運輸:樣品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運輸。